Бактериологическая лаборатория ГВВ № 3 функционирует как самостоятельное подразделение с 1995 г.. Отделение работает в соответствии с Приказом Минздравмедпрома РФ от 19.01.1995 № 8 О развитии и совершенствовании деятельности лабораторий клинической микробиологии (бактериологии) лечебно-профилактических учреждений, Приказом МЗ РФ от 25 декабря 1997 года № 380 О состоянии и мерах по совершенствованию лабораторного обеспечения диагностики и лечения пациентов в учреждениях здравоохранения Российской Федерации, Приказом МЗ РФ от 01 июня 2021 г. № 464 н Об утверждении Правил проведения лабораторных исследований.
Персонал отделения — высококвалифицированные врачи-бактериологи, биолог. Врачи баклаборатории имеют сертификаты по бактериологии, владеют всеми бактериологическими методами исследования. Все специалисты отделения имеют высшую квалификационную категорию, заведующая отделением имеет степень кандидата медицинских наук.
В бактериологической лаборатории проводятся:
Микробиологический анализатор Labsystems iEMS Reader MF.
Анализаторы культур крови Bactec 9050 Becton Dickinson.
Отделение работает в тесном контакте с кафедрой госпитальной терапии ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), которую возглавляет д.м.н. С.А.Рачина.